Tras la primera temporada, Loki se encuentra inmerso en una batalla por el alma de la AVT (Agencia de Variación Temporal). Junto a Mobius, Hunter B-15 y un equipo de personajes nuevos y recurrentes, Loki navega por un multiverso en constante expansión y cada vez más peligroso en busca de Sylvie, la Juez Renslayer, Miss Minutes y la verdad de lo que significa poseer libre albedrío y un glorioso propósito.